Bunun yanı sıra farelerin akciğerlerinde iltihaplanma ve zarar görülmüştür. Mısırla beslenenlerde ise ciddi böbrek ve kan anormallikleri görülmüştür. Mısırla beslenen ineklerde ölüm görülmüştür.

Bitkilere aktarılan gen ya da genler için bir sınırlama yoktur. Bu sebeple evrimsel olarak farlılıklar görülecektir. Bu noktada sürekli aktarım olacaktır. Bunun yanı sıra kontrolsüz tozlaşmayla farklı etkiler görülebilmektedir. Gen aktarımı taşınan bitkilerde özelliklerinin değişmesi ve ürünlerin tek tip olması mümkün olmaktadır.

Ayrıca GDO kullanım sebeplerinden birisi bitkilerin dayanıklılığını ve hastalıklara karşı direncini sağlayıp daha fazla verim almaktır. Bu da insan sağlığında olumsuz etkilere sebep olmaktadır ancak hala etkileri kesin olarak tanımlanamamıştır.

İnsanların kimyasallara bağımlılığını da arttırmaktadır. Bu da çevre kirliliğine neden olmaktadır. GDO’lu ürünleri üreten şirketler daha az kimyasal madde kullanılacağını iddia etse de bu ürünlerde daha fazla kimyasal kullanıldığı gözlemlenmiştir.

GDO, doğal tarımı tehdit etmektedir. Ekosistemi değiştirmekte ve daha çok yapaylaştırmaktadır. Biyolojik kirliliğe sebep olmaktadır. Ayrıca arılar yoluyla organik ürünlere de bulaşmaktadır. GDO’da kullanılan kimyasallar haşere yiyen kuş türlerinin de tükenmesine sebep olmuştur.